MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 34063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018701	AGA	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407722710
2	NC_018701	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722710
3	NC_018701	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407722710
4	NC_018701	CCG	2	6	279	284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722710
5	NC_018701	CGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722710
6	NC_018701	GCA	2	6	299	304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722710
7	NC_018701	AT	3	6	315	320	50 %	50 %	0 %	0 %	407722710
8	NC_018701	TCG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722710
9	NC_018701	GTC	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722710
10	NC_018701	GGT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407722710
11	NC_018701	GAC	3	9	390	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722710
12	NC_018701	CGAT	2	8	449	456	25 %	25 %	25 %	25 %	407722710
13	NC_018701	TCA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722710
14	NC_018701	C	6	6	554	559	0 %	0 %	0 %	100 %	407722710
15	NC_018701	GGT	2	6	573	578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407722710
16	NC_018701	GAT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722710
17	NC_018701	TTC	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407722710
18	NC_018701	TCG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722710
19	NC_018701	CGC	2	6	758	763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722710
20	NC_018701	GATGTC	2	12	843	854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407722710
21	NC_018701	CGAG	2	8	872	879	25 %	0 %	50 %	25 %	407722710
22	NC_018701	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722710
23	NC_018701	ACG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722710
24	NC_018701	GC	3	6	993	998	0 %	0 %	50 %	50 %	407722710
25	NC_018701	TGC	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722710
26	NC_018701	TCGCTC	2	12	1135	1146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407722710
27	NC_018701	GAT	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722710
28	NC_018701	GGA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407722710
29	NC_018701	GC	3	6	1204	1209	0 %	0 %	50 %	50 %	407722711
30	NC_018701	GTC	2	6	1274	1279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722711
31	NC_018701	GCCC	2	8	1296	1303	0 %	0 %	25 %	75 %	407722711
32	NC_018701	TCG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722711
33	NC_018701	CGAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	407722711
34	NC_018701	GGA	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407722711
35	NC_018701	TCG	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722711
36	NC_018701	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722711
37	NC_018701	CAG	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722711
38	NC_018701	ACA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407722711
39	NC_018701	CGG	2	6	1550	1555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722711
40	NC_018701	GGC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722711
41	NC_018701	ACG	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722711
42	NC_018701	AAC	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407722711
43	NC_018701	GGC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722711
44	NC_018701	GAT	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722711
45	NC_018701	CGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722711
46	NC_018701	CCG	2	6	1824	1829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722711
47	NC_018701	CAT	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722711
48	NC_018701	GATG	2	8	1886	1893	25 %	25 %	50 %	0 %	407722711
49	NC_018701	GCC	2	6	2066	2071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722711
50	NC_018701	ACG	2	6	2101	2106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722711
51	NC_018701	AAG	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407722711
52	NC_018701	CGC	2	6	2432	2437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
53	NC_018701	CCG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
54	NC_018701	CGGT	2	8	2457	2464	0 %	25 %	50 %	25 %	407722712
55	NC_018701	TC	3	6	2487	2492	0 %	50 %	0 %	50 %	407722712
56	NC_018701	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
57	NC_018701	ACG	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722712
58	NC_018701	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
59	NC_018701	GCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722712
60	NC_018701	TCG	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
61	NC_018701	GCC	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
62	NC_018701	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
63	NC_018701	CCG	2	6	2935	2940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
64	NC_018701	AGC	3	9	2947	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722712
65	NC_018701	ACG	2	6	3025	3030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722712
66	NC_018701	CAAT	2	8	3059	3066	50 %	25 %	0 %	25 %	407722712
67	NC_018701	A	6	6	3088	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	407722712
68	NC_018701	GCA	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722712
69	NC_018701	CGGC	2	8	3196	3203	0 %	0 %	50 %	50 %	407722712
70	NC_018701	GCC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722712
71	NC_018701	TCC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407722712
72	NC_018701	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
73	NC_018701	GTC	3	9	3429	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
74	NC_018701	ATGC	2	8	3475	3482	25 %	25 %	25 %	25 %	407722712
75	NC_018701	TGC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722712
76	NC_018701	GA	3	6	3531	3536	50 %	0 %	50 %	0 %	407722712
77	NC_018701	GGC	2	6	3558	3563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722712
78	NC_018701	GC	4	8	3635	3642	0 %	0 %	50 %	50 %	407722712
79	NC_018701	T	6	6	4195	4200	0 %	100 %	0 %	0 %	407722713
80	NC_018701	GA	3	6	4213	4218	50 %	0 %	50 %	0 %	407722713
81	NC_018701	TGC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722713
82	NC_018701	GCA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722713
83	NC_018701	CG	3	6	4303	4308	0 %	0 %	50 %	50 %	407722713
84	NC_018701	CCG	2	6	4330	4335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722713
85	NC_018701	GGC	2	6	4344	4349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722713
86	NC_018701	AGT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722713
87	NC_018701	GCC	2	6	4372	4377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722713
88	NC_018701	CGC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722713
89	NC_018701	GAA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407722713
90	NC_018701	CTC	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407722713
91	NC_018701	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722713
92	NC_018701	TCA	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722713
93	NC_018701	TCG	2	6	4605	4610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722713
94	NC_018701	CCG	2	6	4614	4619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722713
95	NC_018701	CGA	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722713
96	NC_018701	AGATCG	2	12	4656	4667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407722713
97	NC_018701	GC	3	6	4715	4720	0 %	0 %	50 %	50 %	407722713
98	NC_018701	GCG	2	6	4768	4773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722713
99	NC_018701	CCGA	2	8	4795	4802	25 %	0 %	25 %	50 %	407722713
100	NC_018701	AGGTGA	2	12	4828	4839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407722713
101	NC_018701	GGC	2	6	4842	4847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722713
102	NC_018701	CGC	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722713
103	NC_018701	GCG	2	6	4947	4952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722713
104	NC_018701	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722714
105	NC_018701	GCC	2	6	5397	5402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722714
106	NC_018701	GCG	3	9	5487	5495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
107	NC_018701	CG	4	8	5561	5568	0 %	0 %	50 %	50 %	407722714
108	NC_018701	GCG	2	6	5612	5617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
109	NC_018701	CGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722714
110	NC_018701	GCG	2	6	5677	5682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
111	NC_018701	GGC	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
112	NC_018701	CT	3	6	5708	5713	0 %	50 %	0 %	50 %	407722714
113	NC_018701	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
114	NC_018701	GCG	2	6	5817	5822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
115	NC_018701	CG	3	6	5834	5839	0 %	0 %	50 %	50 %	407722714
116	NC_018701	GCT	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722714
117	NC_018701	GTC	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722714
118	NC_018701	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722714
119	NC_018701	GCGTG	2	10	5976	5985	0 %	20 %	60 %	20 %	407722714
120	NC_018701	TGC	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407722714
121	NC_018701	CGC	2	6	6014	6019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722714
122	NC_018701	CTT	2	6	6033	6038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407722714
123	NC_018701	GCA	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722714
124	NC_018701	GGCTC	2	10	6082	6091	0 %	20 %	40 %	40 %	407722714
125	NC_018701	CTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407722714
126	NC_018701	CGG	2	6	6241	6246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
127	NC_018701	TCGC	2	8	6279	6286	0 %	25 %	25 %	50 %	407722714
128	NC_018701	CCG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722714
129	NC_018701	GATC	2	8	6347	6354	25 %	25 %	25 %	25 %	407722714
130	NC_018701	CG	3	6	6392	6397	0 %	0 %	50 %	50 %	407722714
131	NC_018701	CGC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722714
132	NC_018701	GCG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722714
133	NC_018701	CCG	2	6	6529	6534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722715
134	NC_018701	GCTC	2	8	6543	6550	0 %	25 %	25 %	50 %	407722715
135	NC_018701	CAC	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407722715
136	NC_018701	CGC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722715
137	NC_018701	CGG	2	6	6698	6703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722715
138	NC_018701	CCGC	2	8	6721	6728	0 %	0 %	25 %	75 %	407722715
139	NC_018701	GC	4	8	6757	6764	0 %	0 %	50 %	50 %	407722715
140	NC_018701	AGCG	2	8	6832	6839	25 %	0 %	50 %	25 %	407722715
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150	NC_018701	CGA	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722716
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154	NC_018701	AGA	2	6	7420	7425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407722716
155	NC_018701	TGG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407722716
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157	NC_018701	CGA	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722716
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159	NC_018701	CGA	3	9	7699	7707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722716
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164	NC_018701	CAGA	2	8	7949	7956	50 %	0 %	25 %	25 %	407722716
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243	NC_018701	TGA	2	6	12681	12686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722720
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247	NC_018701	GCG	2	6	12815	12820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722720
248	NC_018701	GC	3	6	12822	12827	0 %	0 %	50 %	50 %	407722720
249	NC_018701	CCG	2	6	12864	12869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722720
250	NC_018701	CGA	2	6	12876	12881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
251	NC_018701	ACG	2	6	12890	12895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
252	NC_018701	GAC	2	6	12958	12963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
253	NC_018701	CGG	2	6	12987	12992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722720
254	NC_018701	GAT	3	9	13042	13050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722720
255	NC_018701	CGA	2	6	13080	13085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
256	NC_018701	CGG	2	6	13117	13122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722720
257	NC_018701	CGA	2	6	13146	13151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
258	NC_018701	ATC	2	6	13181	13186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722720
259	NC_018701	CGC	2	6	13230	13235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722720
260	NC_018701	GAT	2	6	13285	13290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722720
261	NC_018701	GAGGCG	2	12	13292	13303	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407722720
262	NC_018701	GC	4	8	13316	13323	0 %	0 %	50 %	50 %	407722720
263	NC_018701	CAT	2	6	13345	13350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722720
264	NC_018701	CCG	2	6	13389	13394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722720
265	NC_018701	GA	3	6	13409	13414	50 %	0 %	50 %	0 %	407722720
266	NC_018701	CGA	2	6	13434	13439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
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268	NC_018701	CCATGG	2	12	13467	13478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407722720
269	NC_018701	CGA	2	6	13485	13490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722720
270	NC_018701	GCG	2	6	13492	13497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407722720
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278	NC_018701	TCGCGA	2	12	13843	13854	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407722721
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282	NC_018701	GCC	2	6	14037	14042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722721
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290	NC_018701	GAT	2	6	14282	14287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407722721
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292	NC_018701	GAA	2	6	14619	14624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407722722
293	NC_018701	GGA	2	6	14667	14672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407722722
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300	NC_018701	CATC	2	8	14943	14950	25 %	25 %	0 %	50 %	407722722
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373	NC_018701	TCA	2	6	18034	18039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722725
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375	NC_018701	TCTG	2	8	18975	18982	0 %	50 %	25 %	25 %	407722726
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377	NC_018701	GGATG	2	10	19118	19127	20 %	20 %	60 %	0 %	407722726
378	NC_018701	GGGC	2	8	19163	19170	0 %	0 %	75 %	25 %	407722726
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381	NC_018701	TCA	2	6	19404	19409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407722726
382	NC_018701	GCA	2	6	19424	19429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407722726
383	NC_018701	GGA	2	6	19448	19453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407722726
384	NC_018701	GACG	2	8	19478	19485	25 %	0 %	50 %	25 %	407722726
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386	NC_018701	GCC	2	6	19496	19501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407722726
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